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本发明涉及一种分体式遥操作自动呼吸道标本采集机器人，包括有机器人本体，机器人本体设置有固定臂和操作臂，固定臂包括有成对分布的第一X向导轨，其上分别安装有额头垫高度调整机构、牙托圈高度调整机构，额头垫高度调整机构上设置有额头垫组件，第一X向导轨之间设置有枕板，操作臂包括有成对分布的第二X向导轨，第二X向导轨上设置有镜鞘及升降机构与软管固定及推进机构或是咽拭子及连接管，镜鞘及升降机构上安装有内窥镜头，软管固定及推进机构上安装有咽拭子及连接管，机器人本体上电性连接有控制器。由此，能够在内窥镜头的监视下，在控制器的配合下实现本地自动操作，或是异地远程操控，降低甚至避免医务人员的职业暴露风险。
