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本发明适用医学图像处理技术领域,提供了一种脑组织结构提取方法、装置、设备及存储介质,该方法包括:当接收到脑组织结构提取请求时,接收输入的造影图像,对造影图像进行去颅骨操作,并对得到的图像进行归一化处理,得到归一化图像,对归一化图像进行曲率流平滑去噪处理,得到去噪后图像,使用预设的HMRF分割算法对去噪后图像进行分割,得到脑组织结构,从而在提高脑组织结构提取速率的同时,保证了脑组织结构完整性,进而提高了脑组织结构提取的效率和在工程化应用方面的实用性。