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本发明公开了一种米根霉CH5及其在提取紫芝多糖中的应用,所述应用的方法为:将米根霉CH5孢子接种于含无菌水的紫芝粉中,于28–30℃发酵2–3d,发酵物烘干后,获得发酵紫芝粉;发酵紫芝粉经脱色获得脱色紫芝粉;脱色紫芝粉经水提、浓缩,获得浓缩液;浓缩液经醇沉和真空干燥后,获得紫芝粗多糖。米根霉CH5是从紫芝的微生物富集培养物中分离,经过筛选获得的优良菌株,在紫芝粉中适度生长产生多糖水解酶,对紫芝不溶性多糖结构组织的水解,促进结合态可溶性多糖的解离,从而显著提高了紫芝多糖的提取收率。在优选工艺条件下,紫芝多糖的提取得率为5.92%,较未发酵提取法提高了35%以上。