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本发明公开一种modem文件安全保护方法及系统，其中，方法包括；将原始modem文件的原始块地址、原始Hash以及签名信息组成验证表；在Bootloader启动过程中，采用预设的公钥与签名信息进行匹配，若匹配正确，则获取验证表中原始modem文件的原始块地址，计算当前系统分区modem文件的实时Hash，将实时Hash与原始Hash进行对比，若一致，则判定原始modem文件安全，开机成功；本发明通过对原始modem文件进行两次验证，首先对验证表的签名信息进行验证，确保验证表的签名信息没有被串改，然后对原始modem文件中的原始Hash进行验证，确保原始modem文件未发生改变。
