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本发明公开了一种大脑默认网络的功能连接分析方法。对功能磁共振图像进行预处理,并选取默认模式脑区;将脑区定义为节点,脑区之间的联系定义为边,构成一个含有若干节点的默认模式网络;分析默认模式网络的节点度、集聚系数、最短路径长度,分别应用迪杰斯特拉算法和改进蚁群算法计算默认模式网络的平均距离和哈密顿路径距离,研究默认模式网络节点间的连接特征;找出脑疾病患者和正常人的默认模式网络是否具有相同的平均距离和哈密顿路径,判断两者在相同哈密顿路径方向时是否具有相同的路径长度。本发明通过分析默认模式网络的功能连接,探索正常人与脑疾病患者大脑功能的差异,在认知功能研究、精神疾病诊疗等方面具有一定的应用价值。