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本发明公开了一种计算机可读存储介质、快速启动时钟系统及其控制方法，系统包括：数字辅助电路，用于输出数字控制值；锁相环包括：可编程压控振荡电路和分频电路，可编程压控振荡电路和分频电路连接至数字辅助电路，且分频电路与可编程压控振荡电路相连接，可编程压控振荡电路用于获取数字辅助电路输出的数字控制值，并根据数字控制值输出时钟信号，分频电路用于对可编程压控振荡电路输出的时钟信号进行分频处理；晶体振荡电路，与锁相环相连接，包括：晶体和振荡注入电路，振荡注入电路与晶体连接，振荡注入电路用于将进行分频处理后的时钟信号转变为同频全差分信号，并将同频全差分信号注入到晶体中。
