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本发明公开了一种蛋白AeZDS及其编码基因在提高植物类胡萝卜素积累和抗逆性中的应用。本发明提供一种蛋白,是如下(a)或(b):(a)由序列表中序列SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将序列表中序列SEQ ID NO.2所示的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加的蛋白质。将所述蛋白的编码基因导入拟南芥中,转基因拟南芥中类胡萝卜素含量显著提高,并提高转基因拟南芥植株的抗逆性。类胡萝卜素生物合成和抗逆性相关蛋白AeZDS及其编码基因在调控植物类胡萝卜素生物合成以及抗逆性中具有重要的理论意义和实用价值。