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本发明公开了一种水土保持用枯草芽孢杆菌复合水凝菌剂及制备方法,包括如下重量份的组分:枯草芽孢杆菌活孢粉剂30‑80份、苏云金芽孢杆菌活孢粉剂15‑40份、干酪乳杆菌活孢粉剂15‑40份、谷类皮壳水解物15‑30份、长效缓释储菌凝胶组合物40‑100份。本发明属于复合水凝菌剂技术领域;本发明通过加入长效缓释储菌凝胶组合物,改善了枯草芽孢杆菌在复杂环境下的繁殖条件,提高了枯草芽孢杆菌及其辅助菌株的生存活性及抗逆活性;同时,谷类皮壳水解物通过枯草芽孢杆菌的降解及辅助菌株的降解,形成可以直接被植物吸收的成分,从而提高了植物的生长,本发明提供的复合水凝聚剂可以应用于多种环境中的水土保持,对降低水土流失、形成稳定的生态环境具有重要的价值。