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本发明属于核酸检测回收设备领域,尤其涉及一种核酸检测废液处理设备,包括机架,外壳,机架上方设置有外壳,外壳上端面一侧设置有倾斜向内的进料仓,进料仓中心处设置有进料管道,进料管道下方于外壳内转动设置有第一传送带,第一传送带上沿轮廓边线均匀分布多个夹持仓,夹持仓内设置有用于夹住储液管的夹持组件,进料管道一侧与外壳上端面设置有管体分离仓,管体分离仓内设置有用于将储液管盖子拧下的搓离组件,管体分离仓于第一传送带下方设置有棉签处理仓,棉签处理内转动设置有搅拌杆,棉签处理仓一侧设置有储液管处理仓。本发明能够将储液管内的棉签取出并进行相应处理。