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本发明公开了一种负载纳米载药胶囊的海藻纤维的制备方法。以海藻酸钠为基质制备纳米载药胶囊;并将其添加至海藻酸钠纺丝液中;通过湿法纺丝制备负载载药纳米胶囊的海藻纤维。本发明可以减少纺丝过程中药物的流失,胶囊包覆药物,能够有效防止药物变性,并可负载不同种类的药物。此外,胶囊以海藻酸钠为基质制备,与同质纤维界面相容性好,且载药胶囊呈纳米级别,不会影响海藻酸纺丝液的可纺性及最终纤维性能。本发明可应用于敷料、纱布、绷带、药贴、药垫等医用材料,达到降低伤口感染、发炎,刺激细胞增殖,从而加速创面愈合等作用,还适用于肿瘤手术后的局部化疗。