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本发明提供了一种基于果蝇算法优化梯度提升回归树的青霉素发酵过程软测量建模方法,属于工业发酵生产过程软测量建模和应用领域。该方法通过果蝇优化算法对梯度提升回归树的关键参数进行寻优,实现对青霉素发酵过程的软测量建模,通过青霉素发酵过程中可以实时测量的辅助变量对需要离线测量的青霉素产物浓度进行在线软测量,并结合偏移补偿技术对模型输出值进行校准,为青霉素发酵过程产物浓度的在线实时测量提供了一种方法。本发明的软测量建模方法能提高青霉素发酵过程产物浓度的预测精度,可有效用于指导青霉素的生产。